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大家好！今天普拉特澤生物繼續跟大家一起學習新的實驗文章——CDS和ORF的區別

在基因組學和分子生物學的探索中，NCBI（美國國家生物技術信息中心）扮演著至關重要的數據庫角色。當我們在NCBI中查閱基因序列信息時，經常會碰到“ORF”和“CDS”這兩個概念。它們都與基因中負責編碼蛋白質的區域緊密相關，但在具體定義和應用上卻有所區別。簡單來說，“ORF”指的是開放閱讀框，是基因序列中一段可能編碼蛋白質的連續核苷酸序列；而“CDS”則代表編碼序列，是已經確證為編碼特定蛋白質的核苷酸序列區域。

首先我們先搞清楚何為ORF？

在分子生物學中，開放閱讀框（Open Reading Frame，ORF）從起始密碼子開始，結束于終止密碼子連續的堿基序列，是DNA序列中具有編碼蛋白質潛能的序列。
何為CDS？

與蛋白序列一一對應的DNA序列，并且序列中間不存在其他與蛋白無關的序列

ORF（開放閱讀框）和CDS（編碼序列）的區別與聯系：

定義與性質

ORF：在DNA或RNA序列中，從起始密碼子到終止密碼子之間的一段連續的非中斷的核苷酸序列。它是預測可能編碼蛋白質的區域，但并非所有預測的ORF都能實際編碼出有功能的蛋白質。

CDS：是基因中直接參與蛋白質合成的DNA片段，是已經確證為編碼特定蛋白質的核苷酸序列區域。CDS與mRNA序列一一對應，且中間不存在其他非編碼序列（如內含子）。

確定性與預測性：

ORF：是一種預測結果，基于序列分析得出的可能編碼蛋白質的區域。它可能包含多個，但并不是所有預測的ORF都能被證實為實際的編碼序列。

CDS：是已經通過實驗驗證或數據庫注釋確認的編碼序列，具有更高的確定性和可靠性。

包含關系：

CDS必定是ORF：因為CDS是已經確證的編碼序列，它必然符合從起始密碼子到終止密碼子的連續非中斷序列的定義，因此它一定是一個ORF。

ORF不一定是CDS：預測的ORF可能包含不能編碼蛋白質的序列，或者可能包含多個CDS

今天關于CDS和ORF的區別就分享到這兒啦~如果您在實驗過程中遇到技術問題，或者需要實驗外包和代做，可與我們技術老師聯系18570028002（微信同號）