血管生成實驗結果分析教程——細胞實驗外包
來源/作者:普拉特澤-生物醫學整體課題外包平臺
血管形成實驗結果數據分析由普拉特澤生物給大家總結分享。血管形成實驗在腫瘤醫學的研究與治療中一直是實驗熱點,我們的細胞實驗平臺也承接了上百例血管生成實驗代做服務,血管生成是一個極其復雜的過程,包括血管內皮細胞基質的降解、內皮細胞移行、增殖、管道分化等各種步驟。今天咱們就來看看已經成功形成了血管的實驗結果應該有哪些量化指標與分析步驟吧!
我們常用的量化指標有:number of tubes; number of loops/meshes; number of branch sites/nodes; length of tubes。文獻中常用的分析指標是branch points與capillary length:
現在我們來看看使用ImageJ插件Angiogenesis Analyzer對血管網絡進行定量的詳細步驟!
詳細步驟:1、ImageJ軟件File -> Open打開待分析圖片:
也可通過點擊Angiogenesis Analyzer插件,下載示例圖片:
下載完成后示例圖片會保存在文件夾中:
2. 打開Angiogenesis Analyzer文本文件,即可見Angiogenesis Analyzer分析界面:
點擊扳手形狀選擇Settings可設置測量參數:
點擊Network analysis分析界面,Angiogenesis Analyzer插件可以分析小管形成明場圖片(Phase Contrast)或熒光圖片(Fluo):
本圖片為明場圖片,點擊Analyze HUVEC Phase Contrast,等待分析完成后即可得到分析結果:
3. File -> Save as…即可保存結果到Excel表格,Angiogenesis Analyzer插件可以得到如下諸多結果:
4. Angiogenesis Analyzer插件Analyze Binary Tree也可以分析二值化的網絡結構(如神經元、血管等):
參考文獻:
1. DeCicco-Skinner KL, Henry GH, Cataisson C, et al. Endothelial cell tube formation assay for the in vitro study of angiogenesis. J Vis Exp. 2014
2. Carpentier, G. ImageJ contribution: Angiogenesis Analyzer. ImageJ News. 2012
3. Wüstehube J, Bartol A, Liebler SS, et al. Cerebral cavernous malformation protein CCM1 inhibits sprouting angiogenesis by activating DELTA-NOTCH signaling. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010;107(28):12640-5
好啦,那今天給大家分享的血管形成實驗結果分析就到此為止了,希望能給到大家實驗操過程中的一定的幫助,如果您有血管生成實驗外包的需求,歡迎隨時留言哦!我們下期見~