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EMSA實驗詳細操作步驟【新人干貨】

2022-04-28 14:12:33

來源/作者:普拉特澤-生物醫學整體課題外包平臺

        EMSA實驗詳細操作步驟由普拉特澤生物旗下生物醫學科研培訓品牌——春風學院總結分享,快點學起來吧。普拉特澤生物自建3000平米生物實驗室,專為科研人員提供真實專業的生物實驗外包服務

        

        1、EMSA實驗前準備

        1)合理的實驗方案

        根據研究目的合理設計特異性探針實驗組以及非特異性探針對照組,如有必要還可以添加特異性抗體組、特異性核酸競爭組等。

        2)樣本制備

        可以選擇提取樣本的總蛋白、核蛋白或者使用純化好的目的蛋白。對樣本蛋白進行定量,實驗中需等量加入蛋白。

        3)探針制備

        根據實驗要求設計不同的探針并添加標記,可以合成核酸后自行添加,部分已知蛋白有商業化的抗體也可以直接購買。現在大多數實驗室已經不再使用放射性標記,生物素使用相對較多。

        2、形成蛋白-探針復合物

        1)在0.5 mL離心管中按順序將下列組份混勻:

        蛋白樣本(2-5μg) XμL

        poly d(I-C) 1μL

        Binding Buffer 2μL

        Nuclease-Free ddH2O XμL

        總體積 9 μl

        2)冰浴5 min后,加入1 μ探針。(對照組加1ul對照探針)

        3)PCR儀中室溫(20-23℃)溫育30 min。

        3、制備凝膠,電泳

        1)制備6.5%非變性聚丙烯酰胺凝膠:(注意根據試劑情況按比例調整總體積)

        5XTBE 1 mL

        30%Acrylamide/Bis 2.2 mL

        deionized,sterilewater 6.62 mL

        80%Glycerol 80 μL

        10%AP 90 μL

        TEMED 10 μL

        總體積 10 mL

        2)按標準步驟制備凝膠。

        3)加樣前先在預冷的0.5X TBE buffer中120V預電泳10 min,與電泳完畢后沖洗加樣孔。

        4)混合樣本及電泳緩沖液,點樣電泳。

        5)將電泳槽置于冰上或者4℃環境中,恒壓100V進行電泳,直至緩沖液指示帶距離凝膠底部2~3 cm為止。(大約50-60 min,根據實際情況調整電泳時間及電壓;電泳時間不宜過長)

        4、轉膜

        1)在預冷的0.5XTBE中浸泡凝膠,膜,濾紙和纖維墊。

        2)按如下順序組裝“三明治”:纖維墊,濾紙,凝膠,膜,濾紙,纖維墊。注意電極,確保凝膠位于陰極、膜位于陽極。

        3)在預冷的0.5XTBE中進行轉膜。轉膜裝置應置于冰上或者低溫室中,恒壓60V轉膜1h。(注意根據實際情況調整電壓及時間)。

        5、檢測

        1)去除轉好的膜,放入合適的盛有緩沖液的容器中,沖洗。(注意整個檢測過程避免膜干燥)

        2)去掉沖洗緩沖液,加入封閉液后輕微震蕩,室溫封閉20 min。

        3)加入適量的HRP酶標記的鏈霉親和素(Streptavidin-HRP conjugate),室溫震蕩孵育45 min。(勿將酶標記物直接加到膜上)

        4)去掉酶聯物稀釋液,用洗滌緩沖液洗膜三次,每次室溫輕微震蕩1 0 min。

        5)配置反應底物,均勻加至膜上,室溫孵育5 min。(可以在加完底物后,用薄膜輕輕覆蓋在膜上,使底物均勻覆蓋,注意不要產生氣泡)

        6)化學發光成像系統曝光成像(曝光時間的長短可以根據檢測方法不同而進行相應調整)。
好啦,那關于EMSA凝膠遷移實驗的詳細操作步驟就寫到這里啦,如果您還有其他的不懂可以留言和我們的技術小姐姐交流,更深入的學習哦!下期給大家講講EMSA實驗操作過程中的注意事項,下期見!