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CRISPR/Cas9載體構(gòu)建

CRISPR/Cas9系統(tǒng)的工作原理是crRNA (CRISPR-derived RNA) 通過堿基配對與 tracrRNA (trans-activating RNA) 結(jié)合形成tracrRNA/crRNA 復(fù)合物,此復(fù)合物引導(dǎo)核酸酶 Cas9 蛋白在與 crRNA 配對的序列靶位點處剪切雙鏈 DNA,從而實現(xiàn)對基因組DNA序列進行編輯;而通過人工設(shè)計這兩種 RNA,可以改造形成具有引導(dǎo)作用的gRNA (guide RNA),用以引導(dǎo) Cas9 對 DNA 的定點切割。

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實驗介紹

【技術(shù)原理】

CRISPR/Cas9系統(tǒng)的工作原理是crRNA (CRISPR-derived RNA) 通過堿基配對與 tracrRNA (trans-activating RNA) 結(jié)合形成tracrRNA/crRNA 復(fù)合物,此復(fù)合物引導(dǎo)核酸酶 Cas9 蛋白在與 crRNA 配對的序列靶位點處剪切雙鏈 DNA,從而實現(xiàn)對基因組DNA序列進行編輯;而通過人工設(shè)計這兩種 RNA,可以改造形成具有引導(dǎo)作用的gRNA (guide RNA),用以引導(dǎo) Cas9 對 DNA 的定點切割。

1、靶位點的選擇要求:靶位點主要包括20 個堿基,并且這20 個堿基后面是NGG的PAM 區(qū);靶位點盡量選擇在基因編碼區(qū)的前端;

2、背景載體的選擇要求:根據(jù)具體的實驗需求選擇合適的功能載體;

3、轉(zhuǎn)化應(yīng)選擇對應(yīng)抗性的LB平板培養(yǎng)基。


【實驗流程】

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案例展示

cas9載體構(gòu)建_副本.jpg

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

樣品類型樣品需求保存條件運輸條件備注
動物組織單個樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細(xì)胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細(xì)胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃       

2. 若細(xì)胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細(xì)胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實驗要求的抗體;

2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進行實驗,并提供抗體說明書。

3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實驗所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進行預(yù)實驗,每個基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




細(xì)胞交付標(biāo)準(zhǔn).jpg