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實驗介紹
【實驗介紹】
Co-IP主要用于檢測蛋白質與蛋白質之間相互作用,是IP實驗的一種擴展, 基于IP反應的潛力,在樣品溶液中捕獲和純化主要目標(抗原等)及通過天然相互作用靶標結合的其他的大分子。此外,還可以利用Co-IP來確定在不同條件下的蛋白質相互作用。
CO-IP的應用場景主要是:
1、用于研究蛋白質復合體成分(通過IP級抗體直接捕獲目的蛋白族群,或通過構建帶標簽的目的蛋白融合表達載體并通過標簽蛋白的IP抗體進行免疫捕獲。常與western blot和蛋白質譜聯用進行IP產物分析)。
2、用于檢測生理狀態下存在的蛋白質互作關系。
3、 用于檢測蛋白質的修飾狀態,如泛素化。
【技術原理】
免疫共沉淀是利用抗原和抗體的特異性結合以及細菌的Protein G或A能特異性地結合到免疫球蛋白的Fc片段的方法。其基本原理是在細胞裂解液中加入感興趣蛋白的抗體,孵育后再加入與抗體特異結合的結合于磁珠的Protein G或A,若細胞中存在與興趣蛋白相結合的目的蛋白,就可以形成蛋白復合物:“目的蛋白—興趣蛋白—抗興趣蛋白抗體—Protein G或A”;最后通過免疫印跡實驗來檢測目的蛋白。
【實驗流程】
案例展示
技術總結
【技術總結】
1、實驗樣品制備方法準備:很重要!根據研究目的,檢測樣品可能是組織樣品,也可能是細胞樣品,不同樣品制備流程不太相同,目的蛋白表達量也有較大差別,必須選擇合適的樣品和樣品制備方法。
2、根據研究目的選擇適合的蛋白特異性抗體:非常重要!用于Co-IP實驗的抗體是針對目的蛋白的特異性抗體,最理想的是選擇一種能識別興趣蛋白質某個表位的抗體,且這個表位不會被任何其他蛋白質相互作用所掩蓋,比普通WB抗體要求高出很多;同時,抗體特異性和靈敏性盡可能高,才有可能有干凈的背景和較好的IP效果,所以必須選擇最適合的抗體用于Co-IP實驗。
【注意事項】
1、細胞裂解采用溫和的裂解條件,不能破壞細胞內存在的所有蛋白質-蛋白質相互作用,多采用非離子變性劑(NP-40 或 Triton- X-100)。每種細胞的裂解條件是不一樣的,通過經驗確定;
2、不能用高濃度的變性劑(0.2%SDS),細胞裂解液中要加各種酶抑制劑;
3、使用對照抗體:單克隆抗體:正常小鼠的 IgG 或另一類單抗;兔多克隆抗體:正常兔 IgG;
4、確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的,而并非外源非特異蛋白,單克隆抗體的使用有助于避免污染的發生;
5、要確保抗體的特異性,即在不表達抗原的細胞溶解物中添加抗體后不會引起共沉淀;
6、確定蛋白間的相互作用是發生在細胞中,而不是由于細胞的溶解才發生的,這需要進行蛋白質的定位來確定。
送檢與交付標準
樣品類型 | 樣品需求 | 保存條件 | 運輸條件 | 備注 |
---|---|---|---|---|
動物組織 | 單個樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復凍融以致降解 | -80℃ | 干冰 | 所有樣本均須有唯一標記,且標記清晰可識 |
種子樣本 | 去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個樣品>0.2g。 | -80℃ | 干冰 | |
貼壁/懸浮細胞 | 1. 總RNA或蛋白:106cell/指標、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標、線粒體RNA或蛋白:2*107 cell/指標,樣本盡量新鮮,細胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃ 2. 若細胞處理(加藥、轉染、感染)后狀態差應酌情加大收樣量 | -80℃ | 干冰 | |
全血/血清樣品 | 用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。 | -80℃ | 干冰 | |
石蠟包埋樣品 | 由標準的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。 | -20℃ | 冰袋 | |
抗體 | 1. 按樣本種屬提供滿足相應實驗要求的抗體; 2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進行實驗,并提供抗體說明書。 3.保存抗體的抗體管上應有能夠識別此抗體的標記,抗體的量應大于實驗所需的量。 | -20℃ | 冰袋 | |
引物 | 干粉,≥1OD,如進行預實驗,每個基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。 | -20℃ | 冰袋或常溫 |