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RIP檢測

核酸和蛋白質是組成生命的主要物質,研究細胞內RNA與蛋白結合情況,可以了解轉錄后調控網絡的動態過程,幫助我們發現的miRNA的的的的的調節靶點,RIP檢測實驗是應用于蛋白與RNA互作關系的重要參考。

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實驗介紹

【應用簡介

核酸和蛋白質是組成生命的主要物質,研究細胞內RNA與蛋白結合情況,可以了解轉錄后調控網絡的動態過程,幫助我們發現的miRNA的調節靶點,RIP檢測實驗是應用于蛋白與RNA互作關系的重要參考。


【技術原理圖】

【實驗方法】

第一步:細胞裂解液的制備

第二步:磁珠與抗體的準備

第三步:RNA結合蛋白免疫沉淀

第四步:用蛋白酶?對RNA-蛋白復合物進行消化

第五步:RNA純化

第六步:對結合在復合物上的RNA反轉錄,合成cDNA

第七步:Q-PCR驗證RNA

案例展示

技術總結

【常見問題】

1、經過免疫沉淀后的RNA濃度過低;

2、Input組目的條帶無擴增;

3、RNA純度未在1.8-2.1之間;

4、陰性對照IgG反應中有目的條帶。

 

【注意事項】

1、RIP反應體系中的試劑和抗體中均需保證無RNA酶;

2、細胞樣本的數量較大,應按照所需要求提供細胞樣本數量;

3、選購的相應的抗體應達到IP實驗級別,并通過陰性實驗反饋結果可信性。

送檢與交付標準

樣品類型樣品需求保存條件運輸條件備注
動物組織單個樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標記,且標記清晰可識
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標,樣本盡量新鮮,細胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃       

2. 若細胞處理(加藥、轉染、感染)后狀態差應酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標準的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應實驗要求的抗體;

2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進行實驗,并提供抗體說明書。

3.保存抗體的抗體管上應有能夠識別此抗體的標記,抗體的量應大于實驗所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進行預實驗,每個基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




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