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支原體檢測

支原體是細胞外生存的最小微生物,是一類缺乏細胞壁的原核細胞型微生物,呈高度多形性,有球形、桿形、絲狀、分枝狀等多種形態。通過對支原體特定的序列設計引物,當存在支原體污染時通過PCR特異性擴增,會將目標DNA特異性地復制,然后通過瓊脂糖電泳檢測,會跑出條帶出現陽性結果。反之當沒有支原體污染時,由于沒有模板,PCR無法擴增,則瓊脂糖電泳跑不出條帶,出現陰性結果。

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實驗介紹

【實驗原理】

原核生物的rRNA堿基序列非常保守,而rRNA操縱子上編碼rRNA的DNA間隔區如16S和23S間隔區,各種生物種間的堿基序列差別很大。這個間隔區的 DNA序列及長度在 Mycoplasma 各個種間既有相對保守的部分,也有具有很大差異的部分。本制品是在編碼 16S 和 23S rRNA 的 DNA 上設計一對 F1/R1 引物,擴增編碼 16S 和 23S rRNA 的 DNA 間隔區。此反應體系只特異性擴增 Mycoplasma DNA,檢出靈敏度與特異性都很高。

通過對支原體特定的序列設計引物,當存在支原體污染時通過PCR特異性擴增,會將目標DNA特異性地復制,然后通過瓊脂糖電泳檢測,會跑出條帶出現陽性結果。反之當沒有支原體污染時,由于沒有模板,PCR無法擴增,則瓊脂糖電泳跑不出條帶,出現陰性結果。


【實驗流程】

1596094727295582.png

案例展示


 支原體檢測_副本.png

3個樣本的支原體檢測,分別設置陽性對照Pc: Positive  control,陰性對照Nc: Negative control,待測樣本1, 23。

常見問題

1、取待檢樣本:

一般是接種后進行 3-6d細胞培養的培養上清液;

如果使用 Eagle 等常用的細胞培養基時,培養上清可直接加入到 PCR 反應液中;

如果使用細胞懸濁液作為樣品,則需要提取 DNA,再進行 PCR 反應。    

2、一定要設置陽性對照(一般采用帶有支原體特異片段的質粒)與陰性對照(H2O);

3、配制PCR反應體系時需在超凈工作臺里進行,避免污染。

送檢與交付標準

樣品類型樣品需求保存條件運輸條件備注
動物組織單個樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標記,且標記清晰可識
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標,樣本盡量新鮮,細胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃       

2. 若細胞處理(加藥、轉染、感染)后狀態差應酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標準的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應實驗要求的抗體;

2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進行實驗,并提供抗體說明書。

3.保存抗體的抗體管上應有能夠識別此抗體的標記,抗體的量應大于實驗所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進行預實驗,每個基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




細胞交付標準.jpg